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_新型冠状病毒(SARS-CoV-2)全球研究现状分析

发布时间:2022-09-04 16:50:05 来源:网友投稿

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_新型冠状病毒(SARS-CoV-2)全球研究现状分析

 

 ·新型冠状病毒肺炎·新型冠状病毒(SARS-CoV-2)全球研究现状分析张龙浩 1 ,李柏宏 1 ,贾鹏 2, 3 ,蒲剑 1 ,白蓓 4 ,李音 1 ,朱培嘉 5 ,李雷 6 ,曾国军 7 ,赵欣 4 ,董珊珊 1 ,刘梦菡 1 ,张楠 11. 四川大学华西医院 “双一流”建设办公室(成都 610041)2. 武汉大学 资源与环境科学学院(武汉 430072)3. 空间全生命周期流行病学国际研究中心(香港)4. 四川大学华西医院 院长办公室/应急办(成都 610041)5. 四川大学华西医院 科技部(成都 610041)6. 四川大学华西医院 临床研究管理部(成都 610041)7. 四川大学华西医院 血管外科(成都 610041)【摘要】

  自新型冠状病毒疫情暴发以来,全球已有 26 个国家受到影响,截止 2020 年 2 月 16 日,确诊人数累计超过 6.8 万,世界各国纷纷开展相关研究并发表论文。本文拟及时梳理研究信息,辅助不同岗位工作者在实践或研究中的决策。用新型冠状病毒肺炎(简称新冠肺炎)相关的中英文检索词在 Pubmed、Web of Science、CNKI、万方数据库、维普数据库(VIP database)中进行检索并补充相关专栏文献,对纳入研究的基本信息进行分布描述并对各研究主题的文献进行梳理和总结。最终纳入 301 篇文献,自 1 月中旬论文发表呈上升趋势,2 月 6日单日发表达 50 篇;发表相关论文最多的国家及地区分别是中国内地、美国、英国等;Lancet 及其子刊发表文章数量最多,The New England Journal of Medicine(NEJM)、The Journal of the American Medical Association(JAMA)、Nature 等期刊也纷纷发表相关论文。本文就流行病学、临床特征及诊疗、基础研究、儿童孕妇、心理防护、疫情防控管理等研究方向对新冠肺炎相关研究进行了梳理和总结。【关键词】

 新型冠状病毒肺炎;新型冠状病毒;文献计量分析;推荐学习列表An analysis of global research on SARS-CoV-2ZHANG Longhao

 1 ,

 LI Baihong

 1 ,

 JIA Peng

 2, 3 ,

 PU Jian

 1 ,

 BAI Bei

 4 ,

 LI Yin

 1 ,

 ZHU Peijia

 5 ,

 LI Lei

 6 ,ZENG Guojun

 7 ,

 ZHAO Xin

 4 ,

 DONG Shanshan

 1 ,

 LIU Menghan

 1 ,

 ZHANG Nan

 11. Double First-class Construction Office, West China Hospital, Sichuan University, Chengdu 610041, P.R.China2. Spatial Epidemiology Laboratory, Wuhan University, Wuhan 430072, P.R.China3. International Initiative on Spatial Lifecourse Epidemiology (ISLE), Hong Kong, P.R.China4. Dean’s Office/Department of Emergency Management, West China Hospital, Sichuan University, Chengdu 610041, P.R.China5. Department of Science and Technology, West China Hospital, Sichuan University, Chengdu 610041, P.R.China6. Department of Clinical Research Management, West China Hospital, Sichuan University, Chengdu 610041, P.R.China7. Department of Vascular Surgery, West China Hospital, Sichuan University, Chengdu 610041, P.R.ChinaCorresponding author: PU Jian, Email: hxpujian@163.com; ZENG Guojun, Email: benesun@qq.com【Abstract】

 The SARS-CoV-2 has been spread to 26 countries around the world since its outbreak. By February 16,2020, more than 68 000 people had been diagnosed with COVID-19. Researchers from all over the world have carried outtimely studies on this public health emergency and produced a number of scientific publications. This review aims to re-analyze and summarize the current research findings in a timely manner to guide scholars in relevant fields to furtherSARS-CoV-2 research and assist healthcare professionals in their work and decision-making. The SARS-CoV-2 relatedterms were selected in both English and Chinese and were searched in several major databases, including Pubmed, Web ofScience, CNKI, Wanfang, and VIP databases. The reference list of each search result was screened for relevance, which wasDOI:10.7507/1001-5515.202002034基金项目:四川省科技厅重大项目(2018SZ0353);四川大学华西医院新型冠状病毒肺炎疫情科技攻关项目(HX-2019-nCoV-035)通信作者:蒲剑,Email:hxpujian@163.com;曾国军,Email:benesun@qq.com• 236 • Journal of Biomedical Engineering, Apr. 2020, Vol. 37, No.2 http://www.biomedeng.cn

 further supplemented to the search results. The included studies were categorized by topics with key characteristicsextracted, re-analyzed, and summarized. A total of 301 articles were finally included with 136 in Chinese and 165 inEnglish. The number of publications has rapidly increased since mid-January, 2020, and a peak day was 6th February onwhich 50 articles were published. The top three countries publishing articles were China, the United States and the UnitedKingdom. The Lancet and its specialty journals have published the most articles, with contribution also from journals suchas New England Journal of Medicine (NEJM), The Journal of the American Medical Association (JAMA), and Nature. Allarticles were categorized into epidemiology, clinical diagnosis and treatment, basic research, pregnant women andchildren, mental health, epidemic prevention & control, and others. The literatures related to SARS-CoV-2 are emergingrapidly. It is necessary to sort out and summarize the research topic in time, which has a good reference value for staff indifferent positions. At the same time, it is necessary to strengthen the judgment of the quality of literatures.【Key words】

 COVID-19; SARS-CoV-2; bibliometrics; recommended learning list引言2019 年 12 月,中国湖北省武汉市暴发新型冠状病毒肺炎(简称新冠肺炎,Coronavirus Disease,COVID-19)疫情并迅速扩散。2020 年 1 月 30 日该疫情被世界卫生组织(World Health Organization,WHO)认定为国际关注的突发公共卫生紧急事件(Public Health Emergency of International Concern,PHEIC)

 [2] ,并于 2020 年 2 月 11 日正式命名为COVID-19 [3] 。此次疫情高度疑似于 2019 年 12 月初在武汉华南海鲜市场发生,且最初无法确定其病原 [4] 。随着全球科研力量对疫情迅速反应,在短时间内确定其为一种新型冠状病毒感染所致,并对这种新型冠状病毒进行了全基因组测序,迅速开展各方面研究。以 The New England Journal of Medicine(NEJM)、Lancet、The Journal of the American MedicalAssociation(JAMA)和 The BMJ 为代表的各大期刊纷纷开设新型冠状病毒专题,开放绿色通道,加速同行评议,提前网络发布,采取各种手段为新冠疫情相关科研情况的公开提供帮助 [5-6] 。1 月 30 日,Nature 杂志曾发布新闻,统计文献发表情况,在短短一周的时间内就有近 30 篇文章发表 [7] ,内容包括病毒传播的流行病学分析、病毒蛋白质结构和基因组成研究、临床案例报告、治疗方案/指南,为疫情控制和患者治疗提供了宝贵信息。随着研究的深入,更多研究获得了进展,对疫情的认识更加清晰,也为战胜疫情奠定了基础。本文拟采用文献计量、聚类分类等方法,对现有新冠肺炎相关文献数据进行分析,阐述研究的各类分布,梳理研究方向,并归纳总结研究热点和前沿。随后,通过对期刊影响力以及研究类型判断选取优质文献来构建各研究方向的学习列表,供战“疫”期间不同岗位的医务工作者和不同子领域的预防医学研究人员快速查找当前最新的研究信息,并帮助其有选择地使用不同置信度的结论。同时,在此基础上,各领域工作者可快速跟进新的研究结果,持续加深对新冠肺炎的各研究前沿的了解和认识,从而更有效地辅助工作或研究中的决策,为快速遏制疫情做出贡献。1 方法1.1 数据来源与检索数据库: 大部分研究来自于中国本土,数据库选择PubMed和 Web of Science(WOS)核心合集数据库,以及CNKI 中国知网、万方数据库、维普数据库等中文数据库,同时,对爱思唯尔(Elsevier)、科睿唯安(Clarivate Analytics)、中华医学期刊网等新冠肺炎专栏进行查询。采用 Endnote X8 进行文献管理。文献检索由两名具有循证医学背景和生物医学背景的研究者独立完成,完成后合并文献并去重。英文检索词使用“novel coronavirus”“2019-Novel coronavirus infection”“2019-nCoV”“novelcoronavirus pneumonia”“Novel coronavirus-infec-ted pneumonia”;中文检索词使用“2019 新型冠状病毒”“新型冠状病毒感染”“新型冠状病毒肺炎”“新冠肺炎”等;时间限定为 2019 年 12 月至 2020 年 2 月 10 日;后因文章发表增涨较快,我们于 2020 年 2 月 17 日再次进行补充检索,新增检索词“COVID-19”“SARS-CoV-2”。纳入类型为研究主题和目的与新冠肺炎有关的研究型文献,并排除新闻报道、公众号推文、通知、会议摘要、书籍、政府文件以及科普类文献。[检索策略见 http://生物医学工程学杂志 2020年4月第37卷第2期 • 237 •http://www.biomedeng.cn

 www.biomedeng.cn/article/10.7507/1001-5515.202002034 附表 1。]1.2 数据提取与分析使用 Endnote X8 管理文献,通过人工查询补充缺失信息(如发表时间、题目以及关键词等),导出到 Excel 存储数据,数据整理优化后导入特定制作的标准化 Access 信息提取表,两名研究者独立背对背进行数据提取。提取信息包括:纳入文献的作者、发表时间、题目、关键词、摘要、期刊及期刊影响因子、国家/地区、作者机构和研究主题(流行病学、临床特征及诊疗、基础研究/基因组学/蛋白组学、儿童/孕妇防护、心理防护、疫情防控管理)等信息。采用文献计量学、统计描述等方法对研究基本要素的分布进行分析,并通过关键词分析和摘要主题分析进一步归纳聚类和总结,阐述新冠肺炎相关研究的分布、前沿热点及趋势。使用文献计量学方法,对研究的年份、期刊、国家/地区、研究主题的分布进行分析,通过统计描述和分布图表展示各要素的占比和排序;基于对目前发表的国际国内研究背景和目的综合分析,梳理主要研究方向,并归纳总结 COVID-19 相关的研究热点和前沿。1.3 构建文献学习推荐列表通过对纳入文献的研究方向进行分类,梳理各个研究主题近期发表的研究,并通过一定的排序原则(期刊影响力及研究类型)排序构建 COVID-19各类主题学习列表。2 结果2.1 研究现状截止 2020 年 2 月 17 日,我们共检索得到相关文献 594 篇,去除重复文献以及与新冠肺炎无关的文献,并排除内容为新闻报道、科普推文、政府文件等非学术型文献,最终纳入共计 301 篇。其中英文文献 165 篇,中文文献 136;大学/学院发表 212篇,医院 175 篇,公共卫生机构 52 篇,学会/协会 26 篇;涉及临床特征及诊疗信息的文献 96 篇(含指南、共识、推荐等 43 篇)、基础研究 50 篇、流行病学研究 71 篇,对疫情展开的综述、述评等61 篇。2.1.1 时间分布 新冠肺炎相关文章自 2020 年 1月中旬开始陆续发表,随后发表数量呈线性增长趋势,在短短不到一个月的时间里,共计发表 301 篇文章。其中 2 月 6 日和 2 月 13 日发表数量两次达到高峰,单日发表量分别高达 50 和 36 篇(见图1)。1 月 15 日至 1 月 25 日期间发表的文献大多为英文文献,主要由中外合作或国外发表,大多关注疫情起源和发展,以及病毒的基因组结构;1 月 25日至 1 月 31 日,开始有中文文献发表,关注的研究主题增加了病毒传播形式、疫情防护等;从 2 月 1日开始,有关新冠肺炎确诊病例分析以及诊断技术的文章开始增多,各地区、各场景、各人群的诊疗指南和防控方案也不断涌现;2 月 10 日之后更多的文章关注新冠肺炎的诊断和治疗以及疫情防控管理。但目前仍缺乏新冠肺炎针对性治疗的研究性文章,有少量的中医治疗效果分析。2.1.2 国家及地区分布 已发表的 301 篇文献中,共计有 36 个国家和地区参与,其中含国际/地区合作文章 59 篇。对文章数量贡献最多的国家和地区分别是中国内地(217)、美国(42)、英国(22)、中国香港(18)、德国(12)、意大利(9)、韩国(8)、加拿大(7)和澳大利亚(7)等(见图 2)。中国是新冠1 1 12 2751010 9 13 1325502319 181411163617116701020304050602020/1/15 2020/1/20 2020/1/25 2020/1/30 2020/2/4 2020/2/9 2020/2/14 2020/2/19发文量发表日期图 1 新冠肺炎相关研究发表数量时间趋势Fig.1 Time trend of the number of COVID-19 related research publications• 238 • Journal of Biomedical Engineering, Apr. 2020, Vol. 37, No.2 http://www.biomedeng.cn

 肺炎相关研究的主力,研究主题涵盖新冠肺炎的流行病学史、基因组学、诊断、治疗、公共卫生防护以及各类诊疗和防护指南等;国外发表的文章更多关注新冠肺炎的流行病学、诊断和治疗以及基因组学。2.1.3 期刊分布 共计 147 家中外期刊发表过与...

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