“两会”期间，新一轮的国务院机构改革和职能转变方案正式亮相，在此轮机构改革与职能转变中，我国实行铁路政企分开，国务院组建国家铁路局和中国铁路总公司，不再保留铁道部。将铁道部拟订铁路发展规划和政策的行政职责划入交通运输部。交通运输部统筹规划铁路、公路、水路、民航发展，自此，综合交通运输体系将掀开新的一页。
铁路是国民经济大动脉，在综合交通运输体系中举足轻重。近些年，铁路实现了跨越式发展，保障了国民经济平稳运行和人民生产生活需要，但也存在一些突出问题，主要是政企不分、与其他交通运输方式衔接不畅等。社会各界对铁路改革呼声很高，有关方对铁路改革已研究酝酿多年，铁路改革的条件已经具备，时机已经成熟。
2008年成立的交通运输部，整合了原交通部的职责和原建设部的有关职责，中国民航局、国家邮政局也由交通运输部管理。此次改革是2008年综合交通运输体系改革的深化，其核心是进一步转变政府职能。
按照国务院机构改革和职能转变方案，组建国家铁路局，由交通运输部管理，承担铁道部的其他行政职责，负责拟订铁路技术标准，监督管理铁路安全生产、运输服务质量和铁路工程质量等。组建中国铁路总公司，承担铁道部的企业职责，负责铁路运输统一调度指挥，经营铁路客货运输业务，承担专运、特运任务，负责铁路建设，确保铁路运营秩序和安全，确保重要运输任务完成，不断提高管理水平，为人民群众提供安全、便捷、优质服务。
此轮改革有利于形成政府依法管理、企业自主经营、社会广泛参与的铁路发展新格局。中国铁路总公司成为市场主体，可以落实经营自主权，促进企业内部改革，提高发展内生动力，增强铁路发展后劲，推动铁路建设和运营健康可持续发展。其次，改革明确了中国铁路总公司的安全生产主体责任和国家铁路局的安全监管责任，有利于厘清企业和政府角色，有利于从体制上保障铁路运营秩序和安全。此外，改革有利于充分发挥各种交通运输方式的整体优势和组合效率。由交通运输部统筹规划铁路、公路、水路、民航发展，可以加快推进综合交通运输体系建设，推动各种运输方式协调发展和有机衔接，优化布局结构，形成真正意义上的大交通格局。
作为“大部制”下的首任交通运输部部长，杨传堂表示：“交通运输部将按照中央的部署和要求，狠抓职能转变，加强统筹规划，加快改革攻坚，不断推动交通运输在全面建成小康社会的征程上奋力前行。”他表示，重点要做好五个方面：一是规划引领。将进一步落实《“十二五”综合交通运输体系规划》及其他相关规划，抓紧研究制定“十三五”综合交通运输体系有关规划，确保规划发挥引领作用。二是改革驱动。抓紧研究提出综合交通运输体系改革发展的总体目标，明确改革的路线图、时间表，推进重点项目和关键环节的改革。三是科技支撑。以信息化、智能化带动综合交通运输发展。四是制度规范。研究制定综合交通运输法规体系，逐步完善综合交通运输标准、规范，尽快形成加快综合交通运输发展的制度体系。五是政策激励。逐步形成和完善综合运输政策体系，促进铁路、公路、水路、民航、邮政协调发展。
